一般情況下熒光顯微鏡是根據(jù)光致發(fā)光的原理進行的，是利用一定波長的光激發(fā)顯微鏡下面樣品標本內(nèi)的熒光物質(zhì)。

使得其發(fā)射出熒光呈現(xiàn)出熒光圖像，熒光顯微鏡主要特點是它的光源能夠提供給大量特定的波長范圍內(nèi)的激發(fā)光。

而需要觀察的樣品標本內(nèi)的熒光物質(zhì)獲得了必要的強度的激發(fā)光，為了只讓一特定的波長激發(fā)光照射在樣品標本上，必須在激發(fā)光光源與顯微鏡間光路中安裝激發(fā)濾光器。

而如果為了得到單一的熒光，還需要在物鏡與目鏡間的光路中安裝一吸收濾光片，它能夠?qū)悠窐吮疚蘸蟮募ぐl(fā)光吸收掉并能夠選擇性的讓某一特定波長的熒光通過。